La SIOMI individua tra i propri obiettivi tutelare la professionalità dei medici che praticano la Medicina Omeopatica e promuovere un adeguato livello di qualità del loro operato a salvaguardia della salute dei pazienti attraverso la definizione di strumenti per la convalida della pratica clinica e della ricerca in Omeopatia.Per il raggiungimento di tali obiettivi ha già elaborato delle Linee Guida per la pratica della Omeopatia in Medicina Integrata e per la descrizione di Casi Clinici. La SIOMI nel suo ruolo di Società Medico-Scientifica deve comunque svolgere anche il compito di validare percorsi formativi attraverso l’accreditamento di corsi di formazione e il riconoscimento di rilasciati in ottemperanza ai criteri elaborati dal proprio Dipartimento per la Formazione.